Gerhard Thallinger

Dipl.-Ing. Dr.techn.

20002020
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Forschungsoutput 2000 2019

2000

Control software for high-precision microspotting device

Maurer, M., Hackl, H., Jorde, C., Molidor, R., Thallinger, G., Wach, P. & Trajanoski, Z., 2000, 14th Annual Conference on Computational Genomics; J. Comput. Biol.. ., S. 643-643

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

High resolution CCD scanner for cDNA microarray analysis.

Hackl, H., Thallinger, G., Wach, P., Leberl, F. & Trajanoski, Z., 17 Jan 2000.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Web archive for experiment and image data of protein localisation in yeast cells on an Oracle database

Habeler, G., Natter, K., Thallinger, G., Kohlwein, S-D., Wach, P. & Trajanoski, Z., 2000, Proceedings of the 15th German Conference on Bioinformatics. Berlin: Logos Verlag, S. 43-43

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

YPL.db: An Oracle-based Webarchive for Protein Localization Data from Yeast

Habeler, G., Thallinger, G., Natter, K., Kohlwein, S-D. & Trajanoski, Z., 2000, 14th International Conference on Computational Genomics; J. Comput. Biol.. ., S. 639-639

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

2001

JAVA-based microarray image analysis tool

Molidor, R., Hackl, H., Maurer, M., Thallinger, G., Wach, P. & Trajanoski, Z., 24 Jan 2001.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

YPL.db: A web archive for protein localization data from yeast

Habeler, G., Natter, K., Thallinger, G., Wach, P., Trajanoski, Z. & Kohlwein, SD., 26 Aug 2001.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

2002

Information management systems for pharmacogenomics

Thallinger, G., Trajanoski, S., Stocker, G. & Trajanoski, Z., 2002, in : Pharmacogenomics. 3, S. 651-667

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

YPL.db: the yeast protein localization database

Habeler, G., Natter, K., Thallinger, G., Crawford, ME., Kohlwein, S-D. & Trajanoski, Z., 2002, in : Nucleic acids research. 30, 1, S. 80-83

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

2003

ArrayNorm: A versatile Java tool for microarray normalization, Molecular medicine beyond differentially expressed genes: Systematic approaches and mathematical modeling

Pieler, R., Sánchez Cabo, F., Hackl, H., Thallinger, G., Molidor, R. & Trajanoski, Z., 5 Dez 2003.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Progress Report 2003, Bioinformatics Integration Network

Thallinger, G., Eisenhaber, F., Schuster, P., Kratky, C., Kofler, R. & Trajanoski, Z., 2003, .

Publikation: Buch/Bericht/KonferenzbandSonstiger BerichtForschung

The Yeast Protein Localization Database

Kals, M., Natter, K., Habeler, G., Thallinger, G., Trajanoski, Z. & Kohlwein, SD., 21 Sep 2003.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

YPL.db - The Yeast Protein Localization Database.

Kals, M., Natter, K., Habeler, G., Thallinger, G., Wach, P., Trajanoski, Z. & Kohlwein, SD., 7 Jul 2003.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

2004

ArrayNorm: A versatile Java tool for microarray normalization.

Pieler, R., Sánchez Cabo, F., Hackl, H., Thallinger, G. & Trajanoski, Z., 1 Jul 2004.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

ArrayNorm: comprehensive normalization and analysis of microarray data.

Pieler, R., Sanchez Cabo, F., Hackl, H., Thallinger, G. & Trajanoski, Z., 2004, in : Bioinformatics. 20, 12, S. 1971-1973

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Assessing the Efficiency of Dye-Swap Normalization to Remove Systematic Bias from Two-Color Microarray Data

Sanchez-Cabo, F., Prokesch, A., Thallinger, G., Pieler, R., Trajanoski, Z. & Wolkenhauer, O., 2004

Publikation: Nonprint-FormenWebseite / WebpublikationForschung

Database of Protein Protein Interactions in Crystals

Steinkellner, G., Gruber, K., Jorde, M., Rader, R., Thallinger, G., Kratky, C. & Trajanoski, Z., 8 Nov 2004.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Development of a web based mass spectrometry analysis system.

Hartler, J., Fuchs, T., Thallinger, G., Morandell, S., Huber, LA., Mechtler, K. & Trajanoski, Z., 12 Nov 2004.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

MARS: Microarray Analysis and Retrieval System

Sturn, A., Maurer, M., Molidor, R., Pieler, R., Rainer, J., Mlecnik, B., Truskaller, T., Zeller, D., Trost, E., Sánchez Cabo, F., Hackl, H., Thallinger, G. & Trajanoski, Z., 8 Nov 2004.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

MARS: Microarray Analysis and Retrieval System. Biological Discovery Using Diverse High-Throughput Data

Sturn, A., Maurer, M., Molidor, R., Pieler, R., Rainer, J., Mlecnik, B., Truskaller, T., Zeller, D., Trost, E., Sánchez Cabo, F., Hackl, H., Thallinger, G. & Trajanoski, Z., 20 Mär 2004.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

PPIX- A Database of Protein Protein Interactions in Crystals

Steinkellner, G., Gruber, K., Jorde, M., Rader, R., Thallinger, G. & Kratky, C., 1 Jul 2004.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Progress Report 2004, Bioinformatics Integration Network

Thallinger, G., Eisenhaber, F., Schuster, P., Kratky, C., Kofler, R. & Trajanoski, Z., 2004, .

Publikation: Buch/Bericht/KonferenzbandSonstiger BerichtForschung

TMA db: Verwaltung und Analyse von Tissue Microarray Daten

Thallinger, G., Pirklbauer, M., Uray, M., Pauritsch, E., Buck, CK., Zatloukal, K. & Trajanoski, Z., 12 Nov 2004.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

2005

MARS: Microarray Analysis and Retrieval System

Molidor, R., Sturn, A., Maurer, M., Thallinger, G., Pieler, R., Rainer, J., Mlecnik, B., Truskaller, T., Zeller, D., Trost, E., Sánchez Cabo, F., Hackl, H. & Trajanoski, Z., 27 Jan 2005.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

MARS: Microarray Analysis and Retrieval System. „Bytes & Genes“

Molidor, R., Sturn, A., Maurer, M., Thallinger, G., Pieler, R., Sánchez Cabo, F., Hackl, H. & Trajanoski, Z., 14 Nov 2005.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

MASPECTRAS:Web-based System for Storage, Retrieval, and Analysis of Proteomic LC MS/MS Data.

Hartler, J., Thallinger, G., Stocker, G., Sturn, A., Burkard, T., Körner, E., Fuchs, T., Mechtler, K. & Trajanoski, Z., 29 Aug 2005.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

MASPECTRAS: Web-basiertes Datenbanksystem zur Verwaltung von Proteomik-Daten

Hartler, J., Thallinger, G., Sturn, A., Burkard, T., Körner, E., Fuchs, T., Mechtler, K. & Trajanoski, Z., 1 Okt 2005.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

YPL.db(2): The Yeast Protein Localization database, version 2.0

Kals, M., Natter, K., Thallinger, G., Trajanoski, Z. & Kohlwein, S-D., 2005, in : Yeast. 22, 3, S. 213-218

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

2006

Final Report, Bioinformatics Integration Network

Thallinger, G., Eisenhaber, F., Schuster, P., Kratky, C., Kofler, R. & Trajanoski, Z., 2006, .

Publikation: Buch/Bericht/KonferenzbandSonstiger BerichtForschung

MASPECTRAS:Web-based System for Storage, Retrieval, Quantification and Analysis of Proteomic LC MS/MS Data

Hartler, J., Thallinger, G., Stocker, G., Sturn, A., Burkard, T., Körner, E., Fuchs, T., Mechtler, K. & Trajanoski, Z., 16 Jan 2006.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

The Mutein Database (MutDB)

Thallinger, G., Guggemos, M., Zach, S., Rabin, V., Schittmayer, M. & Glieder, A., 23 Jul 2006.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

2007

Data Management and Analysis for Biomolecular Arrays

Thallinger, G., 2007

Publikation: StudienabschlussarbeitDissertationForschung

First Year Report, Bioinformatics Integration Network II

Thallinger, G., Eisenhaber, F., von Haeseler, A., Schuster, P., Djinovic-Carugo, K., Tilg, B. & Trajanoski, Z., 2007, .

Publikation: Buch/Bericht/KonferenzbandSonstiger BerichtForschung

Kontextualisierung und Visualisierung von komplexen genomischen Daten

Martin, J. G., Boyandin, I., Mlecnik, B., Thallinger, G. & Trajanoski, Z., 2007.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Management and Analysis of Proteomics LC-MS/MS Data

Hartler, J., Thallinger, G., Stocker, G., Sturn, A., Burkard, T., Körner, E., Mechtler, K. & Trajanoski, Z., 28 Jan 2007.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

MASPECTRAS: a platform for management and analysis of proteomics LC-MS/MS data

Hartler, J., Ubaida Mohien, C., Thallinger, G., Stocker, G., Sturn, A., Burkard, T., Körner, E., Rader, R., Schmidt, A., Colinge, J., Mechtler, K. & Trajanoski, Z., 2007.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Open Access
Datei

MASPECTRAS: a platform for management and analysis of proteomics LC-MS/MS data

Hartler, J., Thallinger, G., Stocker, G., Sturn, A., Burkard, T., Körner, E., Rader, R., Schmidt, A., Mechtler, K. & Trajanoski, Z., 2007, in : BMC Bioinformatics . 8, S. 1-13 197.

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Open Access
Datei

TAMEE: data management and analysis for tissue microarrays

Thallinger, G., Baumgartner, K., Pirklbauer, M., Pauritsch, E. M., Uray, M., Mehes, G., Buck, C. R., Zatloukal, K. & Trajanoski, Z., 2007, in : BMC Bioinformatics . 8, S. 81-81

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

2008

Gene expression profiling of suppressor mechanisms in tuberculosis

Smit van Dixhoorn, M. G. A., Munir, R., Sussman, G., Stad, R., de Haan, M., van der Hoeven, T., Rauwerda, H., Thallinger, G. & Wadee, A. A., 2008, in : Molecular immunology. 45, 6, S. 1573-1586

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

MASPECTRAS: a platform for management and analysis of proteomics LC-MS/MS data

Hartler, J., Ubaida Mohien, C., Thallinger, G., Stocker, G., Rader, R., Burkard, T., Colinge, J. & Trajanoski, Z., 2008.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

MASPECTRAS: a platform for management and analysis of proteomics LC-MS/MS data

Hartler, J., Ubaida Mohien, C., Thallinger, G., Stocker, G., Rader, R., Burkard, T., Colinge, J. & Trajanoski, Z., 2008.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Second Year Report, Bioinformatics Integration Network II

Thallinger, G., Eisenhaber, F., von Haeseler, A., Hofacker, I., Djinovic-Carugo, K., Tilg, B. & Trajanoski, Z., 2008, .

Publikation: Buch/Bericht/KonferenzbandSonstiger BerichtForschung

2009

Expression of eukaryotic membrane proteins in Pichia Pastoris - HTP tools and molecular impact

Freigaßner, M. E., Thallinger, G., Drew, D., Cregg, J. & Glieder, A., 2009.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Final Report, Bioinformatics Integration Network II

Thallinger, G., Eisenhaber, F., von Haeseler, A., Hofacker, I., Djinovic-Carugo, K., Baumgartner, C. & Trajanoski, Z., 2009, .

Publikation: Buch/Bericht/KonferenzbandSonstiger BerichtForschung

Gene Expression Analysis of Peripheral Blood in Patients with Alzheimers's Disease

Thallinger, G., Koontz, J., Fang, L., Trajanoski, Z. & Baskys, A., 2009.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Introducing mothur: Open Source, Platform-independent, Community-supported Software for Describing and Comparing Microbial Communities

Schloss, P. D., Westcott, S. L., Ryabin, T., Hall, J. R., Hartmann, M., Hollister, E. B., Lesniewski, R. A., Oakley, B. B., Parks, D. H., Robinson, C. J., Sahl, J. W., Stres, B., Thallinger, G., Van Horn, D. J. & Weber, C. F., 2009, in : Applied and Environmental Microbiology. 75, 23, S. 7537-7541

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Lipid Data Analyzer: Automated Identification and Quantitation of Lipid Species in LC-MS data

Hartler, J., Trötzmüller, M., Eberl, A., Köfeler, H. C., Trajanoski, Z. & Thallinger, G., 2009.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Novel functional profiling approach combining reverse phase protein microarrays and human 3-D ex vivo tissue cultures: expression of apoptosis-related proteins in human colon cancer

Pirnia, F., Pawlak, M., Thallinger, G., Gierke, B., Templin, M. F., Kappeler, A., Betticher, D. C., Gloor, B. & Borner, M. M., 2009, in : Proteomics. 9, 13, S. 3535-3548

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

QPCR: Application for real-time PCR data management and analysis

Pabinger, S., Thallinger, G., Snajder, R., Eichhorn, H., Rader, R. & Trajanoski, Z., 2009, in : BMC Bioinformatics . 10, S. 268-268

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Revealing cellular responses on membrane protein production in Pichia Pastoris

Küberl, A., Freigaßner, M. E., Thallinger, G., Cregg, J. & Glieder, A., 2009.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Sequencing and Annotating Pichia pastoris CBS7435

Küberl, A., Thallinger, G., Schwab, H. & Pichler, H., 2009.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung