Gerhard Thallinger

Dipl.-Ing. Dr.techn.

20002020
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Forschungsoutput 2000 2019

2015

Deriving patterns of gastrointestinal dysbiosis

Halwachs, B., Högenauer, C., Thallinger, G. & Gorkiewicz, G., 10 Jun 2015.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Deriving patterns of gastrointestinal dysbiosis

Halwachs, B., Thallinger, G., Högenauer, C. & Gorkiewicz, G., 2015.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Hydroxynitrile lyase from fern: A Unique Biocatalyst

Lanfranchi, E., Winkler, M., Pavkov-Keller, T., Köhler, E-M., Diepold, M., Darnhofer, B., Steiner, K., Thallinger, G., Birner-Grünberger, R., Van Pelt, S., Gruber, K. & Glieder, A., 21 Sep 2015.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Lipid Data Analyzer (LDA) 2: Flexible and Automatic Identification of Lipid Structures in High-Throughput LC-MSn Data from Various Instruments

Hartler, J., Triebl, A., Trötzmüller, M., Ziegl, A., Rechberger, G., Spener, F., Köfeler, H. & Thallinger, G., 2015.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

miR-199a and miR-497 Are Associated with Better Overall Survival due to Increased Chemosensitivity in Diffuse Large B-Cell Lymphoma Patients.

Troppan, K., Wenzl, K., Pichler, M., Pursche, B., Schwarzenbacher, D., Feichtinger, J., Thallinger, G., Beham-Schmid, C., Neumeister, P. & Deutsch, A. J., 2015, in : International Journal of Molecular Sciences . 16, 8, S. 18077-18095

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Restoration of female fertility in Trichoderma reesei QM6a provides the basis for inbreeding

Linke, R., Thallinger, G., Haarmann, T., Eidner, J., Schreiter, M., Lorenz, P., Seiboth, B. & Kubicek, C. P., 2015, in : Biotechnology for Biofuels . 8, S. 155-155

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

The unique hydroxynitrile lyase from fern

Lanfranchi, E., Winkler, M., Pavkov-Keller, T., Köhler, E-M., Diepold, M., Darnhofer, B., Steiner, K., Thallinger, G., Birner-Grünberger, R., van Pelt, S., Gruber, K. & Glieder, A., 2015.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

2014

Admission To Intensive Care Units And Not Antibiotic Therapy Drives Lower Respiratory Tract Fungal Flora To Candida

Krause, R., Halwachs, B., Klymiuk, I., Gorkiewicz, G., Zollner-Schwetz, I., Hönigl, M., Valentin, T. & Thallinger, G., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

A novel stable isotope labelling assisted workflow for improved untargeted LC-HRMS based metabolomics research

Bueschl, C., Kluger, B., Lemmens, M., Adam, G., Wiesberger, G., Maschietto, V., Marocco, A., Strauss, J., Bödi, S., Thallinger, G., Krska, R. & Schuhmacher, R., 2014, in : Metabolomics. 10, 4, S. 754-769

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

A physicians' wish list for the clinical application of intestinal metagenomics

Klymiuk, I., Högenauer, C., Halwachs, B., Thallinger, G., Fricke, F. W. & Steininger, C., 2014, in : PLoS medicine. 11, 4, S. e1001627-e1001627

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Assessment of lipidomic species in hepatocyte lipid droplets from stressed mouse models

Hartler, J., Köfeler, H., Trötzmüller, M., Thallinger, G. & Spener, F., 2014, in : Scientific Data . 1, 140051, S. 1-12

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Automated structural identification of metabolites by a generic spectra description language utilizing MSn spectra

Hartler, J. & Thallinger, G., 19 Sep 2014, (Eingereicht)

Publikation: SchutzrechtPatentForschung

Candida Colonization of the Lower Respiratory Tract Investigated by Conventional Culture and Fungal Microbiome Analysis

Krause, R., Halwachs, B., Klymiuk, I., Gorkiewicz, G., Zollner-Schwetz, I., Valentin, T., Hönigl, M. & Thallinger, G., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Comparative Genome Analysis of Campylobacter fetus Subspecies Revealed Horizontally Acquired Genetic Elements Important for Virulence and Niche Specificity

Kienesberger, S., Sprenger, H., Wolfgruber, S., Halwachs, B., Thallinger, G., Perez-Perez, G. I., Blaser, M. J., Zechner, E. & Gorkiewicz, G., 2014, in : PLoS ONE. 9, 1, S. e85491-e85491

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Ecology, diversity and ecosystem functioning of Sphagnum-dominated bog microbiome.

Bragina, A., Oberauner-Wappis, L., Berg, C., Zachow, C., Halwachs, B., Thallinger, G., Müller, H. & Berg, G., 14 Jun 2014.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Enhanced whole genome sequence and annotation of Clostridium stercorarium DSM8532T using RNA-seq transcriptomics and high-throughput proteomics

Schellenberg, J. J., Verbeke, T. J., McQueen, P., Krokhin, O. V., Zhang, X., Alvare, G., Fristensky, B., Thallinger, G., Henrissat, B., Wilkins, J. A., Levin, D. B. & Sparling, R., 2014, in : BMC Genomics . 15, 1, S. 567-567

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Finished Genome Sequence of Escherichia coli K-12 Strain HMS174 (ATCC 47011)

Mairhofer, J., Krempl, P., Thallinger, G. & Striedner, G., 2014, in : Genome Announcements. 2, 6, S. e00975-14-e00975-14

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Finished Genome Sequence of the Laboratory Strain Escherichia coli K-12 RV308 (ATCC 31608).

Krempl, P., Mairhofer, J., Striedner, G. & Thallinger, G., 2014, in : Genome Announcements. 2, 6, S. e00971-14-e00971-14

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

From ecology to function: exploring the moss microbiome as a biotechnological resource

Müller, C. A., Bragina, A., Oberauner-Wappis, L., Halwachs, B., Zachow, C., Thallinger, G. & Berg, G., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Identification of active compounds in Lonicera species by means of metabolic profiling with LC-MS

Ortmann, S., Hartler, J., Monschein, M., Miao, J., Zhao, Y. M., Thallinger, G. & Bauer, R., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Integration and validation of resources for high-throughput classification of fungal communities

Halwachs, B., Nilsson, R. H., Abarenkov, K. & Thallinger, G., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Integrative omics analysis. A study based on Plasmodium falciparum mRNA and protein data.

Tomescu, O. A., Mattanovich, D. & Thallinger, G., 2014, in : BMC Systems Biology. 8, Suppl. 2, S. S4-S4

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

LC-MS Metabolic Profiling for the Identification of Active Compounds in Lonicera Species

Ortmann, S., Monschein, M., Hartler, J., Zhao, Y. M., Miao, J., Thallinger, G. & Bauer, R., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

LC-MS metabolic profiling for the identification of bioactive compounds in Lonicera species

Ortmann, S., Monschein, M., Hartler, J., Zhao, Y. M., Miao, J., Thallinger, G. & Bauer, R., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

LC-MS metabolic profiling for the identification of bioactive compounds in medicinal plants

Ortmann, S., Monschein, M., Hartler, J., Zhao, Y. M., Miao, J., Thallinger, G. & Bauer, R., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

LDA 2 - flexible lipid identification for LC-MSn data

Hartler, J., Triebl, A., Trötzmüller, M., Ziegl, A., Köfeler, H. & Thallinger, G., 22 Sep 2014.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Metabolic Profiling mittels LC-MS als Strategie für die Identifizierung von Wirksubstanzen aus Arzneidrogen

Ortmann, S., Monschein, M., Hartler, J., Zhao, Y. M., Miao, J., Thallinger, G. & Bauer, R., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Metabolic Profiling of Clematis Species to Identify Compounds with an Inhibitory Effect on NF-κB Transactivation

Monschein, M., Pferschy-Wenzig, E-M., Ortmann, S., Huber, C., Atanasov, A., Malainer, C., Hartler, J., Heiß, E., Zhao, Y. M., Thallinger, G., Dirsch, V. & Bauer, R., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Metabolic profiling of Lonicera species as a concept to identify compounds with an inhibitory effect on NF-κB transactivation

Ortmann, S., Monschein, M., Hartler, J., Malainer, C., Heiß, E., Zhao, Y. M., Miao, J., Atanasov, A., Thallinger, G., Dirsch, V. & Bauer, R., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Metabolic Profiling of Lonicera Species for the Identification of Constituents Relevant for Inhibition of NO production in LPS-/IFN-γ-stimulated RAW 264.7 mouse macrophages

Ortmann, S., Monschein, M., Hartler, J., Zhao, Y. M., Miao, J., Thallinger, G. & Bauer, R., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

NR4A1-mediated apoptosis supresses lymphomagenesis and is associated with a favorable cancer specific survival in patients with aggressive B-cell lymphomas

Deutsch, A., Rinner, B., Wenzl, K., Pichler, M., Troppan, K., Steinbauer, E., Schwarzenbacher, D., Reitter, S., Feichtinger, J., Tierling, S., Prokesch, A., Scheideler, M., Krogsdam, A., Thallinger, G., Schaider, H., Beham-Schmid, C. & Neumeister, P., 2014, in : Blood. 123, 15, S. 2367-2377

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Peroxidase gene discovery from the horseradish transcriptome

Näätsaari, L., Krainer, F., Schubert, M., Glieder, A. & Thallinger, G., 2014, in : BMC Genomics . 15, 1, S. 227-227

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Resolving tumor heterogeneity: genes involved in chordoma cell development identified by low-template analysis of morphologically distinct cells

El-Heliebi, A., Kroneis, T., Wagner, K., Meditz, K., Kolb, D., Feichtinger, J., Thallinger, G., Quehenberger, F., Liegl-Atzwanger, B. & Rinner, B., 2014, in : PLoS ONE. 9, 2, S. e87663-e87663

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

SnoWMAn: a Straightforward NOvel Webinterface for Microbiome ANalysis

Halwachs, B., Snajder, R., Höftberger, J., Stocker, G., Gorkiewicz, G. & Thallinger, G., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Stenotrophomonas comparative genomics reveals genes and functions that differentiate beneficial and pathogenic bacteria

Alavi, M., Starcher, M., Thallinger, G., Zachow, C., Müller, H. & Berg, G., 2014, in : BMC Genomics . 151, S. 482-482

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

The mzTab Data Exchange Format: communicating MS-based proteomics and metabolomics experimental results to a wider audience

Griss, J., Jones, A. R., Sachsenberg, T., Walzer, M., Laurent, G., Hartler, J., Thallinger, G., Salek, R. M., Steinbeck, C., Nadin, N., Cox, J., Neumann, S., Fan, J., Reisinger, F., Qing-Wei, X., del Toro, N., Perez-Riverol, Y., Ghali, F., Bandeira, N., Xenarios, I. &3 mehrKohlbacher, O., Vizcaino, J. A. & Henning, H., 2014, in : Molecular & cellular proteomics. 13, 10, S. 2765-2775

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Open Access
Datei

The Sphagnum microbiome supports bog ecosystem functioning under extreme conditions.

Bragina, A., Oberauner-Wappis, L., Zachow, C., Halwachs, B., Thallinger, G., Müller, H. & Berg, G., 2014, in : Molecular ecology. 23, 18, S. 4489-4851

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Towards improved membrane protein production in Pichia pastoris: general and specific transcriptional response to membrane protein overexpression

Vogl, T., Thallinger, G., Zellnig, G., Drew, D., Cregg, J., Glieder, A. & Freigaßner, M. E., 2014, in : New biotechnology. 31, 6, S. 538-552

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Triglyceride analysis of complex biological samples using HPLC-HR-AM-MS/MS

Triebl, A., Trötzmüller, M., Hartler, J., Thallinger, G. & Köfeler, H., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Untargeted profiling of tracer-derived metabolites using stable isotopic labeling and fast polarity-switching LC-ESI-HRMS

Kluger, B., Bueschl, C., Neumann, N., Stückler, R., Doppler, M., Chassy, A. W., Waterhouse, A. L., Rechthaler, J., Kampleitner, N., Thallinger, G., Adam, G., Krska, R. & Schuhmacher, R., 2014, in : Analytical Chemistry. 86, 23, S. 11533-11537

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

2013

A Bioinformatics Approach for Integrated Transcriptomic and Proteomic Comparative Analyses of Model and Non-sequenced Anopheline Vectors of Human Malaria Parasites.

Ubaida Mohien, C., Colquhoun, D., Mathias, D., Gibbons, J., Armistead, J., Rodriguez, M., Rodriguez, M., Edwards, N., Hartler, J., Thallinger, G., Graham, D., Martinez-Barnetche, J., Rokas, A. & Dinglasan, R., 2013, in : Molecular & cellular proteomics. 12, 1, S. 120-131

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Open Access
Datei

Alterations in the colonic microbiota in response to osmotic diarrhea

Gorkiewicz, G., Thallinger, G., Trajanoski, S., Lackner, S., Stocker, G., Hinterleitner, T., Gülly, C. & Högenauer, C., 2013, in : PLoS ONE. 8, 2, S. e55817-

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Bioinformatics tools and challenges in structural analysis of lipidomics MS/MS data

Hartler, J., Tharakan, R., Köfeler, H., Graham, D. & Thallinger, G., 2013, in : Briefings in Bioinformatics. 14, 3, S. 375-390

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Campylobacter fetus subspecies as Model Organisms for Studying Niche and Host Adaptations

Sprenger, H., Kienesberger, S., Thallinger, G., Gorkiewicz, G. & Zechner, E. L., 8 Feb 2013.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Chordoma Low-Template Microarray Analysis

Feichtinger, J., El-Heliebi, A., Kroneis, T., Wagner, K., Liegl-Atzwanger, B., Leithner, A., Thallinger, G. & Rinner, B., 2013, (Angenommen/In Druck) Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering. Walter de Gruyter (WdG)

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Comparison of microbial community profiles

Halwachs, B., Fickert, P., Trauner, M., Gorkiewicz, G., Pollheimer, M., Högenauer, C. & Thallinger, G., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Comparison of Osmotic Conditions Based on Integrative Analysis Methods

Tomescu, O. A., Dragosits, M., Graf, A., Gasser, B., Mattanovich, D. & Thallinger, G., 13 Feb 2013.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Complete Genome Sequence of the Sugar Beet Endophyte Pseudomonas poae RE*1-1-14: a Disease-Suppressive Bacterium

Müller, H., Zachow, C., Alavi, M., Tilcher, R., Krempl, P., Thallinger, G. & Berg, G., 2013, in : Genome Announcements. 1, 2, S. e00020-13-

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Complete mitochondrial DNA sequences of the threadfin cichlid (Petrochromis trewavasae) and the blunthead cichlid (Tropheus moorii) and patterns of mitochondrial genome evolution in cichlid fishes.

Fischer, C., Koblmüller, S., Gülly, C., Schlötterer, C., Sturmbauer, C. & Thallinger, G., 2013, in : PLoS ONE. 8, 6, S. e67048-e67048

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung