Gerhard Thallinger

Dipl.-Ing. Dr.techn.

20002020
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Forschungsoutput 2000 2019

2013

Differential RNA‐sequencing (dRNA‐seq) of Campylobacter fetus subspecies.

Gorkiewicz, G., Halwachs, B., Kienesberger, S., Förstner, K. U., Sharma, C., Thallinger, G., Sprenger, H. & Zechner, E., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Integrative Analysis Methods. A study based on P. falciparum mRNA and protein data.

Tomescu, O. A., Mattanovich, D. & Thallinger, G., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Integrative Analysis Methods. A study based on P. falciparum mRNA and protein data.

Tomescu, O. A., Mattanovich, D. & Thallinger, G., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Integrative Analysis of -omics Data: A Method Comparison

Tomescu, O. A., Mattanovich, D. & Thallinger, G., 2013, Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering. Walter de Gruyter (WdG), S. 58-59 ((Suppl 1)).

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Metagenomics to explore function and diversity of the Alpine bog microbiome

Oberauner, L., Müller, H., Zachow, C., Thallinger, G., Bragina, A. & Berg, G., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

More than cell dust: microparticles isolated from cerebrospinal fluid of brain injured patients are messengers carrying mRNAs, miRNAs and proteins

Patz, S., Trattnig, C., Grünbacher, G., Ebner, B., Gülly, C., Novak, A., Rinner, B., Leitinger, G., Absenger, M., Tomescu, O. A., Thallinger, G., Fasching, U., Wissa, S., Archelos-Garcia, J-J. & Schäfer, U., 2013, in : Journal of neurotrauma. 30, 14, S. 1232-1242

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

New horseradish peroxidase isoenzymes and their production in Pichia pastoris

Krainer, F., Näätsaari, L., Thallinger, G., Herwig, C. & Spadiut, O., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Sequencing strategies for metagenomes in enzyme discovery

Halwachs, B., Oberauner-Wappis, L., Müller, H., Berg, G. & Thallinger, G., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

The impact of genetic stress by ATGL deficiency on the lipidome of lipid droplets from murine hepatocytes

Chitraju, C., Trötzmüller, M., Hartler, J., Wolinski, H., Thallinger, G., Haemmerle, G., Zechner, R., Zimmermann, R., Köfeler, H. & Spener, F., 2013, in : Journal of lipid research. 54, 8, S. 2185-2194

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Open Access

Unique functional diversity within Sphagnum peat bogs

Bragina, A., Oberauner-Wappis, L., Halwachs, B., Thallinger, G., Berg, C., Müller, H. & Berg, G., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

2012

10th Austrian Proteomic Research Symposium - Special Focus on Functional Proteomics

Hartler, J. (Hrsg.), Birner-Grünberger, R. (Hrsg.), Gesslbauer, B. (Hrsg.) & Thallinger, G. (Hrsg.), 2012, .

Publikation: Buch/Bericht/KonferenzbandBuch (Herausgeberwerk)Forschung

A Sequence Based Validation of Gene Expression Microarray Data

Thallinger, G., Obermayr, E., Charoentong, P., Tong, D., Trajanoski, Z. & Zeillinger, R., 2012, in : American journal of bioinformatics. 1, 1, S. 1-9

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

A sequence comparison and gene expression data integration add-on for the Pathway Tools software

Krempl, P., Mairhofer, J., Striedner, G. & Thallinger, G., 2012, in : Bioinformatics. 28, 17, S. 2283-2284

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Autoimmune response following influenza vaccination

Perdan-Pirkmajer, K., Thallinger, G., Snoj, N., Cucnik, S., Žigon, P., Kveder, T., Logar, D., Praprotnik, S., Tomsic, M., Sodin-Semrl, S. & Ambrozic, A., 2012, in : Lupus. 21, 2, S. 175-183

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Automated and Reliable Detection and Quantitation of Low Abundant Lipid Species and Other Metabolites in LC-MS Data

Hartler, J., Trötzmüller, M., Fauland, A., Büschl, C., Schuhmacher, R., Köfeler, H. & Thallinger, G., 2012.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Comparison of Osmotic Conditions Based on Integrative Analysis Methods for Omics Data

Tomescu, O. A., Dragosits, M., Graf, A., Gasser, B., Mattanovich, D. & Thallinger, G., 24 Sep 2012.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Comparison of Osmotic Conditions Based on Integrative Analysis Methods for Omics Data

Tomescu, O. A., Dragosits, M., Graf, A., Gasser, B., Mattanovich, D. & Thallinger, G., 2012, 10th Austrian Proteomic Research Symposium (APRS) - Special Focus on Functional Proteomics. ., S. 9-9

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Comparison of Osmotic Conditions Based on Integrative Analysis Methods for -omics Data

Tomescu, O. A., Dragosits, M., Graf, A., Gasser, B., Mattanovich, D. & Thallinger, G., 2012.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Correlation Matrices for the Integrative Analysis of Transcriptome and Metabolome Data Sets

Kopp, W. & Thallinger, G., 2012.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Final Report, Bioinformatics Integration Network III

Thallinger, G., Stark, A., Novatchkova, M., von Haeseler, A., Hofacker, I., Djinovic-Carugo, K., Bennett, K. L., Baumgartner, C., Colinge, J. & Trajanoski, Z., 2012, .

Publikation: Buch/Bericht/KonferenzbandSonstiger BerichtForschung

Functional Categories Associated with Clusters of Genes that are Co-Expressed across the NCI-60 Cancer Cell Lines.

Zeeberg, B. R., Reinhold, W., Snajder, R., Thallinger, G., Kohn, K. W., Pommier, Y. & Weinstein, J. N., 2012, in : PLoS ONE. 7, 1, S. e30317-

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Genomic sequencing of two members of the eco-morphologically diverse cichlid tribe Tropheini

Sturmbauer, C., Gülly, C., Schlötterer, C., Trajanoski, S., Fischer, C. & Thallinger, G., 21 Sep 2012.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

High-throughput characterization and comparison of microbial communities

Halwachs, B., Gorkiewicz, G. & Thallinger, G., 2012, Computational Medicine. Tomlin, C. J. & Greenstreet, M. R. (Hrsg.). 1 Aufl. Wien: Springer, S. 37-57

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in Buch/BerichtForschung

High-Throughput Characterization of Fungal Communities

Halwachs, B. & Thallinger, G., 2012.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

High-Throughput Characterization of Fungal Communities

Halwachs, B. & Thallinger, G., 2012.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Integrative Analysis Methods for Omics Data

Tomescu, O. A., Dragosits, M., Graf, A., Gasser, B., Mattanovich, D. & Thallinger, G., 2012, 11th European Conference on Computational Biology (ECCB 12) - List of accepted poster abstacts. ., S. 2-2

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Integrative Analysis Methods for Omics Data

Tomescu, O. A., Dragosits, M., Graf, A., Gasser, B., Mattanovich, D. & Thallinger, G., 2012.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

International cohort study of 73 anti-Ku positive patients: association of p70/p80 anti-Ku antibodies with joint/bone features and differentiation of disease populations using principle component analysis

Lakota, K., Thallinger, G., Sodin-Semrl, S., Rozman, B., Ambrozic, A., Tomsic, M., Praprotnik, S., Cucnik, S., Mrak-Poljsak, K., Ceribelli, A., Cavazzana, I., Franceschini, F., Vencovsky, J., Czirják, L., Varjú, C., Steiner, G., Aringer, M., Stamenkovic, B., Distler, O., Matucci-Cerinic, M. &1 mehrKveder, T., 2012, in : Arthritis Research & Therapy. 14, 1, S. R2-R2

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Lipid Data Analyzer: automated identification and quantitation of lipid species in LC-MS data

Hartler, J., Trötzmüller, M., Fauland, A., Chitraju, C., Spener, F., Köfeler, H. & Thallinger, G., 6 Mär 2012.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Lipid Data Analyzer: automated identification and quantitation of lipid species in LC-MS data

Hartler, J., Trötzmüller, M., Fauland, A., Büschl, C., Schuhmacher, R., Köfeler, H. & Thallinger, G., 2012.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Lipid Data Analyzer: unattended identification and quantitation of lipids in LC‐MS data

Hartler, J., Trötzmüller, M., Chitraju, C., Spener, F., Köfeler, H. & Thallinger, G., 21 Sep 2012.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Lipidomic analysis of lipid droplets from murine hepatocytes reveals distinct signatures for nutritional stress

Chitraju, C., Trötzmüller, M., Hartler, J., Wolinski, H., Thallinger, G., Lass, A., Zechner, R., Zimmermann, R., Köfeler, H. & Spener, F., 2012, in : Journal of lipid research. 53, 10, S. 2141-2152

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Lipidomics, Mass Spectrometry, and Bioinformatics

Hartler, J., Köfeler, H., Baker, C., Tharakan, R. & Thallinger, G., 2012, Computational Medicine. 1 Aufl. Wien: Springer, S. 93-109

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in Buch/BerichtForschung

Metagenomics to explore the ecology and biotechnological potential of the Alpine bog microbiome

Oberauner, L., Zachow, C., Müller, H., Thallinger, G., Bragina, A. & Berg, G., 17 Sep 2012.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

Metagenomics to explore the ecology and biotechnological potential of the Alpine bog microbiome

Oberauner, L., Zachow, C., Müller, H., Thallinger, G., Bragina, A. & Berg, G., 2012.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Microarray Meta-Analysis: From Data to Expression to Biological Relationships

Feichtinger, J., Thallinger, G., McFarlane, R. J. & Larcombe, L. D., 2012, (Angenommen/In Druck) Computational Medicine: Tools and Challenges. 1 Aufl. Wien: Springer

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in Buch/BerichtForschung

MuteinDB: the mutein database linking substrates, products and enzymatic reactions directly with genetic variants of enzymes

Braun, A., Halwachs, B., Geier, M., Weinhandl, K., Guggemos, M., Marienhagen, J., Ruff, A. J., Schwaneberg, U., Torres Pazmiño, D. E., Rabin, V., Thallinger, G. & Glieder, A., 2012, in : Database - The Journal of Biological Databases and Curation . S. bas028-bas028

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

2011

CODI-STRAT – An Interdisciplinary Network Geared towards Sustainable Management of Chronic and Infective Diseases

Sodin-Semrl, S., Lakota, K. & Thallinger, G., 2011, Proceedings of the 12th International Conference, 23–26. ., S. 237-255

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Could antibodies against serum amyloid A function as physiological regulators in humans?

Lakota, K., Thallinger, G., Cucnik, S., Bozic, B., Mrak-Poljsak, K., Ambrozic, A., Rozman, B., Blinc, A., Tomsic, M. & Sodin-Semrl, S., 2011, in : Autoimmunity. 44, 2, S. 149-158

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Genome Sequence of the Ruminal Bacterium Megasphaera elsdenii

Marx, H., Graf, A. B., Tatoo, N. E., Thallinger, G., Mattanovich, D. & Sauer, M., 2011, in : Journal of bacteriology. 193, 19, S. 5578-5579

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

GiSAO.db: a database for ageing research.

Hofer, E., Laschober, G. T., Hackl, M., Thallinger, G., Günter, L., Grillari, J., Jansen-Dürr, P. & Trajanoski, Z., 2011, in : BMC Genomics . 12, 1, S. 262-262

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435

Küberl, A., Schneider, J., Thallinger, G., Anderl, I., Wibberg, D., Hajek, T., Jaenicke, S., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Szczepanowski, R., Pühler, A., Schwab, H., Glieder, A. & Pichler, H., 2011, in : Journal of Biotechnology. 154, S. 312-320

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Lipid Data Analyzer: unattended identification and quantitation of lipids in LC-MS data

Hartler, J., Trötzmüller, M., Chitraju, C., Spener, F., Köfeler, H. & Thallinger, G., 2011, in : Bioinformatics. 27, 4, S. 572-577

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Phytochemical cluster analysis of extracts from Huang Lian Jie Du Tang and its single constituents

Widowitz, U., Thallinger, G. & Bauer, R., 2011.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Population dynamics of the colonic microbiota in response to osmotic diarrhea

Gorkiewicz, G., Thallinger, G., Trajanoski, S., Stocker, G., Hinterleitner, T., Gülly, C. & Högenauer, C., 2011.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Population dynamics of the colonic microbiota in response to osmotic diarrhea

Gorkiewicz, G., Thallinger, G., Trajanoski, S., Stocker, G., Hinterleitner, T., Gülly, C. & Högenauer, C., 2011.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Second Year Report, Bioinformatics Integration Network III

Thallinger, G., Stark, A., Novatchkova, M., von Haeseler, A., Hofacker, I., Djinovic-Carugo, K., Bennett, K. L., Baumgartner, C., Colinge, J. & Trajanoski, Z., 2011, .

Publikation: Buch/Bericht/KonferenzbandSonstiger BerichtForschung

SnoWMAn: high throughput phylotyping

Stocker, G., Snajder, R., Halwachs, B., Trajanoski, S., Gorkiewicz, G. & Thallinger, G., 2011.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

The complete genome sequence of the rumen bacterium Megasphaera elsdenii

Marx, H., Graf, A. B., Tatoo, N. E., Thallinger, G., Mattanovich, D. & Sauer, M., 2011.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung