Vertebrae Segmentation in 3D CT Images based on a Variational Framework

Kerstin Hammernik, Thomas Ebner, Darko Stern, Martin Urschler, Thomas Pock

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in Buch/Bericht

Abstract

Automatic segmentation of 3D vertebrae is a challenging task in medical imaging. In this paper, we introduce a total variation (TV) based framework that incorporates an a priori model, i.e., a vertebral mean shape, image intensity and edge information. The algorithm was evaluated using leave-one-out cross validation on a data set containing ten computed tomography scans and ground truth segmentations provided for the CSI MICCAI 2014 spine and vertebrae segmentation challenge. We achieve promising results in terms of the Dice Similarity Coefficient (DSC) of 0.93±0.04 averaged over the whole data set.
Originalspracheenglisch
TitelRecent Advances in Computational Methods and Clinical Applications for Spine Imaging and Clinical Applications for Spine Imaging
UntertitelPart VI
Redakteure/-innenJianhua Yao, Ben Glocker, Tobias Klinder, Shuo Li
ErscheinungsortSwitzerland
Herausgeber (Verlag)Springer International Publishing AG
Seiten227-233
ISBN (elektronisch)978-3-319-14148-0
ISBN (Print)978-3-319-14147-3
DOIs
PublikationsstatusVeröffentlicht - 2015

Publikationsreihe

NameLecture Notes in Computational Vision and Biomechanics
Herausgeber (Verlag)Springer International Publishing
Band20

Fields of Expertise

  • Information, Communication & Computing
  • Human- & Biotechnology

Treatment code (Nähere Zuordnung)

  • Basic - Fundamental (Grundlagenforschung)

Kooperationen

  • BioTechMed-Graz

Fingerprint Untersuchen Sie die Forschungsthemen von „Vertebrae Segmentation in 3D CT Images based on a Variational Framework“. Zusammen bilden sie einen einzigartigen Fingerprint.

  • Honourable Mention Award

    Martin Urschler (Empfänger/-in), Thomas Ebner (Empfänger/-in), Darko Stern (Empfänger/-in), Thomas Pock (Empfänger/-in) & Kerstin Hammernik (Empfänger/-in), 14 Sep 2014

    Auszeichnung: Preise / Medaillen / Ehrungen

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