Jan Egger

Dr.rer.physiol. Priv.-Doz. Dr.rer.nat.

20132020

Publikationen pro Jahr

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Publikationen

2020

A comprehensive Workflow and Framework for immersive Virtual Endoscopy of dissected Aortae from CTA Data

Egger, J., Gunacker, S., Pepe, A., Melito, G. M., Gsaxner, C., Li, J., Ellermann, K. & Chen, X., 2020, Proceedings SPIE: Medical Imaging 2020: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling. Band 11315.

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IRIS: interactive real-time feedback image segmentation with deep learning

Pepe, A., Schussnig, R., Li, J., Gsaxner, C., Chen, X., Fries, T. P. & Egger, J., 2020.

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2019

A Client/Server Based Online Environment for Manual Segmentation of Medical Images

Wild, D., Weber, M. & Egger, J., 2019, The 23rd Central European Seminar on Computer Graphics (CESCG). S. 1-8

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A Client/Server based Online Environment for the Calculation of Medical Segmentation Scores

Weber, M., Wild, D., Wallner, J. & Egger, J., 2019, 2019 41st Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC). S. 3463-3467 5 S.

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A Marker-Less Registration Approach for Mixed Reality–Aided Maxillofacial Surgery: a Pilot Evaluation

Pepe, A., Trotta, G. F., Mohr-Ziak, P., Gsaxner, C., Wallner, J., Bevilacqua, V. & Egger, J., 4 Sep 2019, in : Journal of digital imaging. 32, 6, S. 1008-1018 11 S.

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A Review on Multiplatform Evaluations of Semi-Automatic Open-Source Based Image Segmentation for Cranio-Maxillofacial Surgery

Wallner, J., Schwaiger, M., Hochegger, K. M., Gsaxner, C., Zemann, W. & Egger, J., 2019, in : Computer methods and programs in biomedicine. 182, 23 S., 105102.

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Automated Computer-aided Design of Cranial Implants Using a Deep Volumetric Convolutional Denoising Autoencoder

Morais, A., Egger, J. & Alves, V., 2019, New Knowledge in Information Systems and Technologies: WorldCIST'19 2019. Rocha, Á., Adeli, H., Reis, L. & Costanzo, S. (Hrsg.). Cham: Springer, Band 1. S. 151-160 (Advances in Intelligent Systems and Computing; Band 932).

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Computed tomography data collection of the complete human mandible and valid clinical ground truth models

Wallner, J., Mischak, I. & Egger, J., 2019, in : Scientific Data . 6, 14 S., 190003.

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Open Access

Depth-Awareness in a System for Mixed-Reality Aided Surgical Procedures

Sylos Labini, M., Gsaxner, C., Pepe, A., Wallner, J., Egger, J. & Bevilacqua, V., 2019, Intelligent Computing Methodologies - 15th International Conference, ICIC 2019, Proceedings. Huang, Z-K., Hussain, A. & Huang, D-S. (Hrsg.). Springer Verlag Heidelberg, S. 716-726 11 S. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Band 11645 LNAI).

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Exploit fully automatic low-level segmented PET data for training high-level deep learning algorithms for the corresponding CT data

Gsaxner, C., Roth, P. M., Egger, J. & Wallner, J., 2019, in : PLoS ONE. S. e0212550

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Facial model collection for medical augmented reality in oncologic cranio-maxillofacial surgery

Gsaxner, C., Wallner, J., Chen, X., Zemann, W. & Egger, J., 9 Dez 2019, in : Scientific Data . 2019, 1

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Free thoracodorsal, perforator-scapular flap based on the angular artery (TDAP-Scap-aa): Clinical experiences and description of a novel technique for single flap reconstruction of extensive oromandibular defects

Pau, M., Wallner, J., Feichtinger, M., Schwaiger, M., Egger, J., Cambiaso-Daniel, J., Winter, R., Jakse, N. & Zemann, W., 2019, in : Journal of Cranio-Maxillofacial Surgery. 47, 10, S. 1617-1625

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Learning from the Truth: Fully Automatic Ground Truth Generation for Training of Medical Deep Learning Networks

Gsaxner, C., Roth, P. M., Wallner, J. & Egger, J., 2019, Proceedings of the Joint ARW & OAGM Workshop 2019. Pichler, A., Roth, P. M., Slabatnig, R., Stübl, G. & Vincze, M. (Hrsg.). Graz: Verlag der Technischen Universität Graz, S. 173-174

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Open Access

Markerless Image-to-Face Registration for Untethered Augmented Reality in Head and Neck Surgery

Gsaxner, C., Pepe, A., Schmalstieg, D., Egger, J. & Wallner, J., 2019, International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention. S. 236-244

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Pattern Recognition and Mixed Reality for Computer-Aided Maxillofacial Surgery and Oncological Assessment

Pepe, A., Trotta, G. F., Gsaxner, C., Schmalstieg, D., Wallner, J., Egger, J. & Bevilacqua, V., 2019, BMEiCON 2018 - 11th Biomedical Engineering International Conference. 8609921

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Using Synthetic Training Data for Deep Learning-Based GBM Segmentation

Lindner, L., Narnhofer, D., Weber, M., Gsaxner, C., Egger, J. & Kolodziej, M., 2019, 2019 41st Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC). Institute of Electrical and Electronics Engineers, S. 6724-6729 6 S.

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2018

Chemotherapeutic agents eligible for prior dosing in pancreatic cancer patients requiring hemodialysis: A systematic review

Hann, A., Nosalski, E., Hermann, P. C., Egger, J., Seufferlein, T. & Keller, F., 1 Aug 2018, in : Clinical Nephrology. 90, 2, S. 125-141 17 S.

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Clinical evaluation of semi-automatic open-source algorithmic software segmentation of the mandibular bone: Practical feasibility and assessment of a new course of action

Wallner, J., Hochegger, K., Chen, X., Mischak, I., Reinbacher, K., Pau, M., Zrnc, T., Schwenzer-Zimmerer, K., Zemann, W., Schmalstieg, D. & Egger, J., 2018, in : PLoS ONE. 13, 5

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Open Access

Exploit 18F-FDG enhanced urinary bladder in PET data for deep learning ground truth generation in CT scans

Gsaxner, C., Pfarrkirchner, B., Lindner, L., Jakse, N., Wallner, J., Schmalstieg, D. & Egger, J., 12 Mär 2018, Medical Imaging 2018: Biomedical Applications in Molecular, Structural, and Functional Imaging. SPIE Press, SPIE - The International Society for Optical Engineering

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Fully Convolutional Mandible Segmentation on a valid Ground-Truth Dataset

Egger, J., Pfarrkirchner, B., Gsaxner, C., Lindner, L., Schmalstieg, D. & Wallner, J., 2018, Proceedings IEEE Engineering in Medicine and Biology Conference (EMBC).

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Lower jawbone data generation for deep learning tools under MeVisLab

Pfarrkirchner, B., Gsaxner, C., Lindner, L., Jakse, N., Wallner, J., Schmalstieg, D. & Egger, J., 2018.

Publikation: KonferenzbeitragPaperForschungBegutachtung

Multi-threaded integration of HTC-Vive and MeVisLab

Gunacker, S., Gall, M., Schmalstieg, D. & Egger, J., 2018.

Publikation: KonferenzbeitragPaperForschungBegutachtung

TuMore: generation of synthetic brain tumor MRI data for deep learning based segmentation approaches

Lindner, L., Pfarrkirchner, B., Gsaxner, C., Schmalstieg, D. & Egger, J., 2018.

Publikation: KonferenzbeitragPaperForschungBegutachtung

Open Access
2017

Algorithm guided outlining of 105 pancreatic cancer liver metastases in Ultrasound

Hann, A., Bettac, L., Haenle, M. M., Graeter, T., Berger, A. W., Dreyhaupt, J., Schmalstieg, D., Zoller, W. G. & Egger, J., 6 Okt 2017, in : Scientific Reports. 7, 1, S. 12779

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Algorithmic evaluation of lower jawbone segmentations

Egger, J., Hochegger, K., Gall, M., Chen, X., Reinbacher, K., Schwenzer-Zimmerer, K., Schmalstieg, D. & Wallner, J., 1 Feb 2017, Proc. SPIE Medical Imaging. Orlando, FL, USA

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Augmented Reality (AR)-guided intraoperative Navigation

Egger, J., 2017.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschung

Automatic urinary bladder segmentation in CT images using deep learning

Gsaxner, C., 2017

Publikation: StudienabschlussarbeitMasterarbeitForschung

A VR-based surgical simulation system using patient- specific physical computing model

Egger, J., 2017.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschungBegutachtung

Computer-aided implant design for the restoration of cranial defects

Chen, X., Xu, L., Li, X. & Egger, J., 23 Jun 2017, in : Scientific Reports. 7, 1, S. 4199

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Computer-aided position planning of miniplates to treat facial bone defects

Egger, J., Wallner, J., Gall, M., Chen, X., Schwenzer-Zimmerer, K., Reinbacher, K. & Schmalstieg, D., 2017, in : PLoS ONE. 12, 8, S. e0182839

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Feasibility of alternating induction and maintenance chemotherapy in pancreatic cancer

Hann, A., Bohle, W., Egger, J. & Zoller, W., 31 Jan 2017, in : Scientific Reports. 7, 7 S., 41549.

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

HTC Vive MeVisLab integration via OpenVR for medical applications

Egger, J., Gall, M., Wallner, J., Boechat, P., Hann, A., Li, X., Chen, X. & Schmalstieg, D., 2017, in : PLoS ONE. 12, 3, S. e0173972

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

In-depth Assessment of an Interactive Graph-based Approach for the Segmentation for Pancreatic Metastasis in Ultrasound Acquisitions of the Liver with two Specialists in Internal Medicine

Egger, J., Chen, X., Bettac, L., Haenle, M. M., Graeter, T., Zoller, W., Schmalstieg, D. & Hann, A., 2017.

Publikation: KonferenzbeitragPaperForschungBegutachtung

Integration of the HTC Vive into the Medical Platform MeVisLab

Egger, J., 2017.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschungBegutachtung

Integration of the HTC Vive into the Medical Platform MeVisLab

Egger, J., Gall, M., Hann, A., Li, X., Chen, X., Schmalstieg, D., Boechat de Almeida Germano, P. & Wallner, J., 1 Feb 2017, Proc. SPIE Medical Imaging. Orlando, FL, USA

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Interactive algorithm for the measurement of pancreatic cancer liver metastases in ultrasound

Egger, J., 2017.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschungBegutachtung

Interactive Outlining of Pancreatic Cancer Liver Metastases in Ultrasound Images

Egger, J., Schmalstieg, D., Chen, X., Zoller, W. G. & Hann, A., 18 Apr 2017, in : Scientific Reports. 7, 1, S. 892

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Interactive Planning of Miniplates

Gall, M., Reinbacher, K., Stanzel, J., Chen, X., Schwenzer-Zimmerer, K., Wallner, J., Schmalstieg, D. & Egger, J., 1 Feb 2017, Proc. SPIE Medical Imaging. Orlando, FL, USA

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Interactive Planning of Miniplates

Egger, J., 2017.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschungBegutachtung

Interactive reconstructions of cranial 3D implants under MeVisLab as an alternative to commercial planning software

Egger, J., Gall, M., Tax, A., Ücal, M., Zefferer, U., Li, X., von Campe, G., Schäfer, U., Schmalstieg, D. & Chen, X., 2017, in : PLoS ONE. 12, 3, S. e0172694

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Interaktive Planung von Gesichtsimplantaten

Egger, J., 2017.

Publikation: KonferenzbeitragPosterForschungBegutachtung

Interaktive Planung von Gesichtsimplantaten

Gall, M., Reinbacher, K., Schwenzer-Zimmerer, K., Schmalstieg, D., Egger, J. & Wallner, J., 1 Mär 2017, Proc. Bildverarbeitung fuer die Medizin (BVM). Heidelberg, Germany

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Vertebral body segmentation with GrowCut: Initial experience, workflow and practical application

Egger, J., Nimsky, C. & Chen, X., 2017, in : SAGE open medicine. 5, S. 2050312117740984

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

2016

AR (augmented reality)-Paradigmenwechsel im Therapiedesign

Reinbacher, K., Wallner, J., Egger, J., Voglreiter, P., Pau, M., Zrnc, T., Feichtinger, M. & Schwenzer-Zimmerer, K., 2016.

Publikation: Konferenzbeitrag(Altdaten) Vortrag oder PräsentationForschung

A semi-automatic computer-aided method for surgical template design

Chen, X., Xu, L., Yang, Y. & Egger, J., 2016, in : Scientific Reports. S. 1-18

Publikation: Beitrag in einer FachzeitschriftArtikelForschungBegutachtung

Open Access
Datei

Clinical Evaluation of Mandibular Bone Segmentation

Egger, J., Hochegger, K., Gall, M., Reinbacher, K., Schwenzer-Zimmerer, K., Wallner, J. & Schmalstieg, D., 1 Aug 2016, Proc. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC'16), Posters. Orlando, FL, USA: IEEE Computer Society

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung

Computer-Aided Planning and Reconstruction of Cranial 3D Implants

Gall, M., Li, X., Chen, X., Schmalstieg, D. & Egger, J., 1 Aug 2016, Proc. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC'16). Orlando, FL, USA

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandBeitrag in einem KonferenzbandForschungBegutachtung